Bioinformatika

tugas softskil ke-4

BIOINFORMATIKA

Bioinformatika ialah ilmu yang mempelajari penerapan teknik komputasi untuk mengelola dan menganalisis informasi hayati. Bidang ini mencakup penerapan metode-metode matematika, statistika, dan informatika untuk memecahkan masalah-masalah biologi, terutama yang terkait dengan penggunaan sekuens DNA dan asam amino. selain itu, bioinformatika dapat dipakai pula untuk menebuakan sel rangkaian DNA dalam tubuh kita dari DNA kita bisa mengetahui siapa orang tua kandung kita sebenarnya melalui serangkain tes DNA karena DNA pada sang anak tidak akan jauh dari DNA orang tua nya

Kemampuan untuk memahami dan memanipulasi kode genetik DNA ini sangat didukung oleh teknologi informasi melalui perkembangan hardware dan soffware. Baik pihak pabrikan sofware dan harware maupun pihak ketiga dalam produksi perangkat lunak. Salah satu contohnya dapat dilihat pada upaya Celera Genomics, perusahaan bioteknologi Amerika Serikat yang melakukan pembacaan sekuen genom manusia yang secara maksimal memanfaatkan teknologi informasi sehingga bisa melakukan pekerjaannya dalam waktu yang singkat (hanya beberapa tahun).

Perkembangan jaringan internet juga mendukung berkembangnya bioinformatika. Pangkalan data bioinformatika yang terhubungkan melalui internet memudahkan ilmuwan dalam mengumpulkan hasil sekuensing ke dalam pangkalan data tersebut serta memperoleh sekuens biologi sebagai bahan analisis. 

bidang bidang yang terkait dalam bioinformatika terutama biasanya dalam bidang kedokteran.

Bioinformatika, sesuai dengan asal katanya yaitu “bio” dan “informatika”, adalah gabungan antara ilmu biologi dan ilmu teknik informasi (TI). Pada umumnya, Bioinformatika didefenisikan sebagai aplikasi dari alat komputasi dan analisa untuk menangkap dan menginterpretasikan data-data biologi. Ilmu ini merupakan ilmu baru yang yang merangkup berbagai disiplin ilmu termasuk ilmu komputer, matematika dan fisika, biologi, dan ilmu kedokteran, dimana kesemuanya saling menunjang dan saling bermanfaat satu sama lainnya.

Saat ini, perkembangan ilmu biologi sangat dipengaruhi oleh perkembangan ilmu bioinformatika. Tidaklah dapat dimungkiri kalau bioinformatika telah mempercepat kemajuan ilmu biologi. Lebih jauh lagi, kalau dilihat dari bidang yang lebih spesifik, kemajuan suatu bidang sangat dipengaruhi oleh kemajuan bioinformatika. Semakin maju bioinformatika di suatu bidang (ditandai dengan banyaknya software yang tersedia), semakin maju pulalah bidang tersebut.

Khusus di bidang Virologi (ilmu virus), kemajuan bioinformatika telah berperan dalam mempercepat kemajuan ilmu ini. Sebelum kemajuan bioinformatika, untuk mengklasifikasikan virus kita harus melihat morfologinya terlebih dahulu. Untuk melihat morfologi virus dengan akurat, biasanya digunakan mikroskop elektron yang harganya sangat mahal sehingga tidak bisa dimiliki oleh semua laboratorium. Selain itu, kita harus bisa mengisolasi dan mendapatkan virus itu sendiri.

referensi : http://bioinformatika-q.blogspot.com/ 

http://ilmukomputer.org/2006/08/25/bioinformatika-dalam-kedokteran/

http://ilmukomputer.org/2006/08/24/bioinformatika-dalam-virologi/

Paralel Processing

tugas softskill ke-3

paralel processing merupakan penggunaan lebih dari satu CPU untuk menjalankan menjalankan program secara bersamaan.

Pemrograman Paralel sendiri adalah teknik pemrograman komputer yang memungkinkan eksekusi perintah/operasi secara bersamaan. Bila komputer yang digunakan secara bersamaan tersebut dilakukan oleh komputer-komputer terpisah yang terhubung dalam satu jaringan komputer, biasanya disebut sistem terdistribusi

Hubungan antara paralel processing dengan komputasi modern :

Untuk melakukan berbagai jenis komputasi paralel diperlukan infrastruktur mesin paralel yang terdiri dari banyak komputer yang dihubungkan dengan jaringan dan mampu bekerja secara paralel untuk menyelesaikan satu masalah. paralel processing tidak bisa berjalan dengan baik tanpa menggunakan alat pemrosesan seperti Komputer yang di hubungkan dengan komputer yang lainnya dengan bantuan sistem jaringan. selain itu dalam menyelesaikan suatu permasalahan misalnya kita akan menyelesaikannya permasalahan mengenai numerik dengan  menggunakannya algoritma Pararel, dari algoritma paralel itu lah bekerja karena permasalahan numerik memerlukan kecepatan komputasi yang sangat tinggi.

referensi :http://ghani.gxrg.org/2011/04/01/kinerja-komputasi-dengan-parallel-processing/
                      http://blog.rian.web.id/komputasi_dengan_parallel_processing.html

Tugas Softskil Pertemuan ke 2

artikel singkat mengenai...

Komputasi Modern

Komputasi modern merupakan alagoritma yang digunakan untuk menyelesaikan suatu permasalahan dari data yang diinput. komputasi merupakan bagian ilmu komputer yang dipadukan dengan ilmu matematika.

bahkan awal mulanya komputasi modern itu berasal dari perhitungan secara manual dengan menggunakan kapur, batu tulis. Namun seiring dengan perkembangan jaman komputasi digunakan untuk memecahkan masalah dengan menggunakan alat atau simulasi komputer. awal mulanya komputer diciptakan yaitu sebagai alat hitung numerik atau yang disebut dengan mesin hitung (kalkulator) namun pada tahun 1931 kalkulator diciptakan tidak hanya berhitung saja tetapi dapat menyelesaikan persamaan differensial kompleks yang selama ini dianggap rumit oleh kalangan akademisi. setelah itu berkembang lagi menjadi komputer dari generasi ke generasi mulai dari komputer generasi pertama oleh ENIAC, komputer generasi ke dua, komputer generasi ke tiga, komputer generasi ke empat, komputer generasi ke lima. 

namun dalam perkembangan komputer modern dimulai dengan dua teknologi yang terpisah- perhitungan otomatis dan dapat di program tapi tidak ada satu perangkat pun yang dapat dikatakan sebagai komputer. oleh karena itu muncullah komputasi modern pada tahun 1903-1957 yang di ciptakan oleh John von Neumann. beliau meletakan dasar-dasar komputer modern.

 

Von Neumann seorang ilmuan yang belajar dari Berlin dan Zurich dan mendapatkan diploma pada bidang teknik kimia pada tahun 1926.

Kegeniusannya dalam matematika telah terlihat semenjak kecil dengan mampu melakukan pembagian bilangan delapan digit (angka) di dalam kepalanya

Dipicu ketertarikannya pada hidrodinamika dan kesulitan penyelesaian persamaan diferensial parsial nonlinier yang digunakan, Von Neumann kemudian beralih dalam bidang komputasi. Sebagai konsultan pada pengembangan ENIAC, dia merancang konsep arsitektur komputer yang masih dipakai sampai sekarang. Arsitektur Von Nuemann adalah komputer dengan program yang tersimpan (program dan data disimpan pada memori) dengan pengendali pusat, I/O, dan memori. berdasarkan beberapa definisi di atas, maka komputasi modern dapat diartikan sebagai suatu pemecahan masalah berdasarkan suatu inputan dengan menggunakan algoritma dimana penerapannya menggunakan berbagai teknologi yang telah berkembang seperti komputer. 

untuk saat ini sudah banyak macam macam komputasi modern yang telah dikembangkan diantaranya :

• mobile Computing 

komputasi bergerak memiliki beberapa penjelasan, salah satunya komputasi bergerak merupakan kemajuan teknologi komputer sehingga dapat berkomunikasi menggunakan jaringan tanpa menggunakan kabel dan mudah dibawa atau berpindah tempat, tetapi berbeda dengan komputasi nirkabel.contohnya GPS

• Grid computing 

Komputasi grid menggunakan komputer yang terpisah oleh geografis, didistibusikan dan terhubung oleh jaringan untuk menyelasaikan masalah komputasi skala besar.

• Cloud computing  

Komputasi cloud menggambarkan pelengkap baru, konsumsi dan layanan IT berbasis model dalam internet, dan biasanya melibatkan ketentuan dari keterukuran dinamis dan sumber daya virtual yang sering menyediakan layanan melalui internet. 

referensi : http://ebyfebryy.blogspot.com/2011/03/tugas-softskill-artikel-tentang.html 

http://beniputra.wordpress.com/

http://rzbeuty.blogspot.com/2012/03/artikel-komputasi-modern.html